Previsões dos especialistas reunidos pelo Ibama no Comitê para a Conservação dos Cervídeos dão menos de dez anos para que o cervo-do-pantanal desapareça de vez do território paulista, onde antes havia população abundante.A espécie também podia ser encontrada em extensas regiões do Paraná, Minas Gerais, Mato Grosso do Sul, Goiás e Bahia. À exceção do Pantanal matogrossense, nas demais áreas a situação do animal é crítica. A espécie está na lista vermelha dos animais em perigo. A situação crítica do cervo-do-pantanal, assim como das outras sete espécies de cervídeos brasileiros deve-se, principalmente, à destruição das áreas naturais para o avanço agropecuário, a construção de grandes empreendimentos e à caça. A drenagem clandestina das áreas de várzea e o contato forçado dos veados com o gado doméstico e os búfalos são outras formas de ameaça para os animais. Além do cervo-do-pantanal, existem no Brasil o veado-de-mão-curta (Mazama nana), o veado-catingueiro (Mazama gouazobira), o veado-bororó (Mazama bororo), o veado-campeiro (Ozotoceros bezzoarticus), o veado-materio (Mazama americana), o cariacu (Odocoileus virginianos) e o Mazama nemorivaga.