Em 2000, a Secretaria do Meio Ambiente, por meio da Coordenadoria de Planejamento Estratégico e Educação Ambiental e da Fundação Florestal, assinou convênio com o DER - Departamento de Estrada de Rodagem, que disponibilizou recursos da ordem de R$ 1.200.000,00, para a segunda etapa da compensação ambiental.
Para os municípios de São Paulo e Guarulhos, também cortados pela rodovia e que apresentam intensa ocupação urbana já consolidada, foram realizados programas de educação ambiental e a adequação dos instrumentos legais de uso e ocupação do solo nas faixas marginais da rodovia.
Nesse contexto, as prefeituras elaboraram, com a participação da sociedade civil e das câmaras municipais, projetos de proteção e recuperação ambiental, promovendo a sustentabilidade e a geração de emprego e renda. Uma parcela de recursos será destinada a ações de caráter regional, como equipamentos para programas de prevenção de poluição do ar, combate a incêndios florestais e projetos de educação ambiental.
Como exemplo de projeto local, pode-se citar o do Município de Atibaia, que estará recuperando uma área do Parque Municipal Grota Funda, onde será implantada área de pesquisas ambientais, além de propiciar à população local e regional mais uma alternativa de espaço público para visitação. Já o Município de Bom Jesus dos Perdões estará montando um Centro de Pesquisas Ambientais com um laboratório equipado para análises da qualidade das águas e outros itens de interesse local.
A entrega dos veículos foi acompanhada pelo representante da Coordenadoria de Planejamento Estratégico e Educação Ambiental, Martinus Filet, que participou de todo o processo de elaboração e implementação do projeto de compensação ambiental.